疫苗从生产企业装车运送至疾控中心贮存冷库的过程中，应该有一整条没有任何中断的“冷链”保证疫苗安全。
运送的冷藏车内应有专门的测温设施，工作人员每隔几分钟记录下车内的温度变化。
冷藏车到达贮存冷库时，工作人员查看温控记录，一切正常再将疫苗登记入库。
疫苗库包括冷藏库和冷冻库，冷藏库的温度应控制在2℃-8℃，冷冻库则在-20℃左右，设置电子测温器，每天进行多次自动测温。测温系统与部门员工手机相连，一旦温度超过要求的范围，每个人的手机上都会收到报警短信，以便于立即采取行动保证疫苗安全。
为保障疫苗运输过程中的安全和有效，应实施疫苗统一物流配送，由专业的物流公司按需求和时间来为各个接种门诊配送疫苗，保证运输环节的冷链要求。接种门诊收到配送的疫苗后要立即放入冷库内的冰箱、冰柜储存，并且每天至少两次为疫苗测温，并制作成曲线图，监测温度的温度变化。
除此之外，在各个接种门诊，疫苗接种前、接种中、接种后都应有完整的、科学的、规范的要求保证预防接种的安全性，各级疾控部门应定期对参与疫苗接种的医务人员进行严格的技术培训和资质考核，并对各接种门诊进行综合督查。
完整连续的数据支持对疫苗冷链管理很重要
疫苗冷链数据的内容包含疫苗的基本信息、冷链设备的基本信息及其维护记录、监测设备的基本信息和维护记录、冷链管理者的基本信息。根据疫苗冷链的运行方向，由起点制造商出品开始，呈分支分布形态向受种人群移动终到达受种人。根据疫苗冷链的目前状况和管理特点，整个冷链可以被分为三个分段，分别是首段、中段和末段。
首段是从制造商生产线下线后的产品开始，到省市级的医疗卫生机构入库为止。这个冷链分段中含有各级单位的库存、批发、运输。一般来说，冷链首段的冷链数据是完整的，管理质量是可以得到保证的。
中段的起点由省市级医疗卫生机构向下配发疫苗时的出库节点，到地市区县的医疗卫生机构接收入库为止。冷链中段的数据也比较完整，但是缺乏效率，运输工具的冷链质量保障在部分地区存在缺陷，冷链监测工具大多是手工登记操作。在疫苗运输过程中的冷链管理要依靠医疗卫生机构的冷链运输工具或者是第三方物流商提供的运输服务来完成，所获得的冷链数据的完整性可能受到影响的因素比较复杂，因此这个冷链段需要提高监控手段。
末段数据，还可以细分为前后两个段，先是从地市区县的医疗卫生机构库存到社区卫生服务中心(接种点)库存，然后到受种人完成接种。末段数据完整性容易出现空白，其特点是时间和温度的不确定性大，数据获取困难。
