随着航空货运价格下跌，海运不断提升运力，推高价格。早在二月份，中国的许多码头就已经堆满了到港的集装箱和铁矿石。仓库爆仓，堆满了由于货车短缺而无法出口的货物。由于收不到零部件，许多工厂无法开工。由于中国减少采购石油、铁矿和煤矿，油轮和散货船的日租金环比骤跌逾70%。港口和海关办公室维持着正常运转。困难主要在于货物的码头装卸问题。

今年一月，农历新年前，全国停工停产近一个月，一些工厂目前仍有当时已生产但未能运出的货物库存。海运起重机等设备仍能够正常运行，但货车的短缺使许多港口难以将卸载的货物运输出去。

中国三大海港——上海港、宁波港及天津新港——堆满了盛满进口蔬果和冷冻肉品的冷藏集装箱。由于许多工厂仅保留了部分产能，而且许多成品无法通过货车递送，因此集装箱船运企业纷纷停运。船运企业也难以为远航归来的船员提供轮休替岗的机会。全球商船在岗船员中，中国船员所占比例约为七分之一（Bradsherand Chokshi）。

就运力管理而言，病情爆发后的头五个月，货运尚能维持，但自2020年6月以来，货运价格一再被需求推高。电子商务的快速发展和船运旺季的到来更将货运价格推至历史新高，且预计到年底都将居高不下。