在遇到前所未有的发展高峰期的同时，因疫情反复，冷链物流相比其他行业遭受了更为直接的冲击。在“防疫”与“贸易”的双向平衡中，“断链”问题也更加凸显。冷链物流直接面对的两大难题是疫情的影响和断链带来的一系列连锁反应。

“疫情对（冷链）的影响是非常大的。首先，一旦发现冷库或者冷链的某个物流端口存在，需要封闭消杀，引发长时间停业整顿。这段时间，不仅没有收入，整个消杀整顿、问题产品处理等工作还会花费很大的成本。第二，应对冷链行业来说，有很多难题需要解决。现在还没有很完美的方法。”
疫情对冷链的影响具有两面性。冷链物流保障了国人正常的生活水平，让更多人认识到冷链的重要性。但是低温下存活更久，天津、大连、北京等城市曾多次发现以冷库为中心的传播链条。尤其是在国内外防疫政策差异化的情况下，多次在进口的冷冻食品中检测出阳性。
中国每年都有大量肉类、水果从国外运送到国内。相关数据显示，2021年国内进口食品规模达到1346亿美元。进口的果品数量与金额分别达746.76万吨和158.97亿美元，创历史新高。肉类进口量累计达938万吨。
深圳市盐田港是四大港，也是中国重要的进出口港口。“因为疫情，盐田港曾经停摆过，引起了全球货运的震荡。国外疫情比中国严重。病毒不能完全杀死，它残留外包装还是食品表面，你无法察觉，那怎么把好国门？”