第三方医药冷链物流企业在冷藏药品供应链中处于一个特殊位置，它集“医药企业物流”与“物流企业”于一身，它既可以是医药生产者的成品库，又可能成为批发交易的终端（医疗单位或零售商）寄存库。当委托方（制药厂、批发商、零售药店、医院等）向其上级供货商下达采购订单时，供货商从其仓库发货至第三方医药冷链物流中心，第三方医药冷链物流中心按照GSP监管标准进行验收入库，并进行冷藏药品的存储及化管理，当委托方将到货预报发送给第三方医药冷链物流中心时，第三方医药冷链物流中心根据其要求进行全程冷链配送活动。同时，上级供货商可将其冷藏药品全部或部分储存在第三方医药冷链物流中心，当下级订货商向上级供货商下达订单时，第三方医药冷链物流中心可代理进行订单处理、配送等活动。在整个运作模式中，第三方医药冷链物流中心采用物联网、云技术以及如基于互联网的GIS、GPS技术、EDI、RFID射频技术等先进的信息化技术进行全程温湿度监管和数据记录，并与CFDA等监管部门，以及医药生产企业及流通企业进行实时双向数据交换和共享，实现信息同步化。保障从生产企业到消费者（患者）的全流程追溯防伪，当冷藏药品出现质量问题时也便于进行责任追溯，可以从一定程度上保障冷藏药品的质量安全。